Mikro ihracat için belirli kurallar ve kısıtlamalar bulunmaktadır. Bu kurallar ve kısıtlamalar, ürünlerin niteliğine, türüne ve kullanım amacına göre farklılık gösterir. Örneğin, bedelsiz ürün gönderimi, limitli ürün gönderimi, tamir amaçlı çıkışlar, dahilde ve hariçte işlenen ürünler gibi durumlar mikro ihracat kapsamı dışındadır.

Bununla birlikte, mikro ihracatı yapılması yasak olan ürünler de bulunmaktadır. Bu ürünler arasında odun, tarihi eserler, tütün tohumları ve fideleri, kapya cinsi kırmızı biber, meyan kökü, ham lüle taşı, zeytinyağı ve salep gibi ürünler bulunmaktadır.